Ο Σεβ. Μητροπολίτης μας κ. Αμφιλόχιος είχε την μεγάλη ευλογία και τιμή να μετέχει των εργασιών της Αγίας και Μεγάλης Συνόδου, η οποία πραγματοποιήθηκε από τις 20 έως 25 Ιουνίου εις τους χώρους της Ορθοδόξου Ακαδημίας Κρήτης. Ο Επίσκοπος μας μετείχε ως μέλος της Αντιπροσωπείας του Οικουμενικού Πατριαρχείου, καθώς ήταν ένας από τους εικοσιτέσσερις (24) Αρχιερείς του Οικουμενικού Θρόνου που η ΑΘΠ, ο Οικουμενικός ημών Πατριάρχης κ.κ. Βαρθολομαίος είχε επιλέξει δια να συμμετέχουν ως μέλη της Αντιπροσωπείας του Οικουμενικού Πατριαρχείου εις την Αγία και Μεγάλη Σύνοδο.
Κάθε Αντιπροσωπεία αποτελείτο από τον Προκαθήμενο της τοπικής Εκκλησίας, 24 Συνοδικά μέλη Αρχιερείς και 5 μέλη (ειδικοί Σύμβουλοι). Στην Αντιπροσωπεία του Οικουμενικού Πατριαρχείου είχε συμπεριληφθεί, επίσης και ο Σεβ. Αρχιεπίσκοπος Κρήτης κ. Ειρηναίος. Τα Συνοδικά μέλη είχαν δικαίωμα λόγου, ενώ οι ειδικοί Σύμβουλοι μετείχαν άνευ δικαιώματος λόγου. Κατά την διάρκεια των εργασιών της Αγίας και Μεγάλης Συνόδου ο Επίσκοπος μας έλαβε τον λόγο και αφού εξέφρασε ευχαριστίες και ευγνωμοσύνη δια την επιλογή της Ορθοδόξου Ακαδημίας Κρήτης ως τόπος διεξαγωγής του κορυφαίου ετούτου «ιστορικού γεγονότος», όπως το χαρακτήρισε, τοποθετήθηκε επί των προς συζήτηση θεμάτων. Στο τέλος της Συνόδου υπέγραψε και τα Συνοδικά Πρακτικά.
Τα θέματα που συζητήθηκαν και λήφθηκαν σχετικές αποφάσεις είναι τα εξής: 1. Η αποστολή της Ορθοδόξου Εκκλησίας στον σύγχρονο κόσμο. 2. Το Αυτόνομον και ο τρόπος ανακηρύξεως αυτού. 3. Η Ορθόδοξος Διασπορά. 4. Το μυστήριον του γάμου και τα κωλύματα αυτού. 5. Η σπουδαιότης της νηστείας και η τήρησις αυτής σήμερον. 6. Σχέσεις της Ορθοδόξου Εκκλησίας προς τον λοιπόν Χριστιανικόν κόσμον.
